Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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Clk2O35491 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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Clk2O35491 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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Clk2O35491 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Clk2O35491 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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Clk2O35491 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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Clk2O35491 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Clk2O35491 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk2O35491 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk2O35491 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Clk2O35491 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clk2O35491 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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