Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Edil3O35474 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edil3O35474 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms