Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd2O35392 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd2O35392 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd2O35392 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd2O35392 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd2O35392 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd2O35392 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Foxd2O35392 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd2O35392 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd2O35392 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd2O35392 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Foxd2O35392 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Foxd2O35392 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Foxd2O35392 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Foxd2O35392 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Foxd2O35392 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Foxd2O35392 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Foxd2O35392 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Foxd2O35392 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Foxd2O35392 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Foxd2O35392 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Foxd2O35392 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Foxd2O35392 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd2O35392 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Foxd2O35392 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Foxd2O35392 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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