Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srsf5O35326 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srsf5O35326 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms