Protein–RNA interactions for Protein: O35199

Vmn2r89, Putative pheromone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r89O35199 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn2r89O35199 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms