Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtgisO35074 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtgisO35074 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtgisO35074 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtgisO35074 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtgisO35074 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtgisO35074 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtgisO35074 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtgisO35074 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgisO35074 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgisO35074 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgisO35074 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgisO35074 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms