Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn4O35054 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn4O35054 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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