Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC117090L7N257 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms