Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm2888K7N746 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm2888K7N746 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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