Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms