Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm20795J3QP49 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm20795J3QP49 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm20795J3QP49 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm20795J3QP49 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm20795J3QP49 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm20795J3QP49 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm20795J3QP49 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20795J3QP49 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm20795J3QP49 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm20795J3QP49 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20795J3QP49 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20795J3QP49 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20795J3QP49 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20795J3QP49 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20795J3QP49 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20795J3QP49 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20795J3QP49 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20795J3QP49 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20795J3QP49 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20795J3QP49 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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