Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21900J3QP38 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21900J3QP38 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21900J3QP38 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21900J3QP38 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21900J3QP38 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21900J3QP38 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21900J3QP38 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21900J3QP38 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21900J3QP38 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21900J3QP38 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21900J3QP38 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21900J3QP38 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21900J3QP38 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm21900J3QP38 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm21900J3QP38 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm21900J3QP38 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm21900J3QP38 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm21900J3QP38 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm21900J3QP38 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm21900J3QP38 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm21900J3QP38 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm21900J3QP38 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm21900J3QP38 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm21900J3QP38 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm21900J3QP38 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm21900J3QP38 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm21900J3QP38 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21900J3QP38 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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