Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm19965J3QNY8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms