Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Gm11236J3QMS7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Gm11236J3QMS7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Gm11236J3QMS7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Gm11236J3QMS7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gm11236J3QMS7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gm11236J3QMS7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm11236J3QMS7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm11236J3QMS7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm11236J3QMS7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm11236J3QMS7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm11236J3QMS7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm11236J3QMS7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm11236J3QMS7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm11236J3QMS7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Gm11236J3QMS7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm11236J3QMS7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm11236J3QMS7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm11236J3QMS7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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