Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm20873J3QMQ9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm20873J3QMQ9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm20873J3QMQ9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm20873J3QMQ9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm20873J3QMQ9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20873J3QMQ9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm20873J3QMQ9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm20873J3QMQ9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Gm20873J3QMQ9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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