Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21060J3KMU4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm21060J3KMU4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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