Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gm3443F7CCV5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gm3443F7CCV5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm3443F7CCV5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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