Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm28038F7BCN9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm28038F7BCN9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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