Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm28048F7BCN0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gm28048F7BCN0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gm28048F7BCN0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gm28048F7BCN0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gm28048F7BCN0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm28048F7BCN0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm28048F7BCN0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm28048F7BCN0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm28048F7BCN0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28048F7BCN0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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