Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms