Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8005F6YKY3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm8005F6YKY3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms