Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm10378F6XQQ1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm10378F6XQQ1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Gm10378F6XQQ1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Gm10378F6XQQ1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Gm10378F6XQQ1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Gm10378F6XQQ1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Gm10378F6XQQ1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Gm10378F6XQQ1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Gm10378F6XQQ1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Gm10378F6XQQ1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm10378F6XQQ1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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