Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Crocc2F6XLV1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Crocc2F6XLV1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms