Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5861F6VCN9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5861F6VCN9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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