Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzd7E9Q9W7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms