Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
6030445D17RikE9Q8F9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms