Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gm17727E9Q4V7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gm17727E9Q4V7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm17727E9Q4V7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm17727E9Q4V7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm17727E9Q4V7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm17727E9Q4V7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm17727E9Q4V7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm17727E9Q4V7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm17727E9Q4V7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm17727E9Q4V7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm17727E9Q4V7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17727E9Q4V7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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