Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Zfp558E9Q1J0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Zfp558E9Q1J0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Zfp558E9Q1J0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Zfp558E9Q1J0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Zfp558E9Q1J0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Zfp558E9Q1J0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Zfp558E9Q1J0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Zfp558E9Q1J0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Zfp558E9Q1J0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Zfp558E9Q1J0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp558E9Q1J0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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