Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gcom1E9PZ54 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms