Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsph10bE9PYQ0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsph10bE9PYQ0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms