Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cngb1E1AZ71 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cngb1E1AZ71 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms