Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5478D3Z6R0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm5478D3Z6R0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm5478D3Z6R0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm5478D3Z6R0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm5478D3Z6R0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm5478D3Z6R0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm5478D3Z6R0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5478D3Z6R0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5478D3Z6R0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5478D3Z6R0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5478D3Z6R0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5478D3Z6R0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm5478D3Z6R0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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