Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms