Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms