Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf217D3YYI7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf217D3YYI7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf217D3YYI7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf217D3YYI7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf217D3YYI7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf217D3YYI7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf217D3YYI7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf217D3YYI7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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