Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc170D3YXL0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms