Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm3259D3YUK0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm3259D3YUK0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm3259D3YUK0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm3259D3YUK0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm3259D3YUK0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm3259D3YUK0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm3259D3YUK0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm3259D3YUK0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm3259D3YUK0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm3259D3YUK0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3259D3YUK0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm3259D3YUK0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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