Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2d4D3YUH6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms