Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms