Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nlrc5C3VPR6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc5C3VPR6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms