Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smok3bC0HKC9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms