Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmf1B9EKI3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms