Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phf11bB4XVQ1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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