Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah3B2RWG3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah3B2RWG3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms