Protein–RNA interactions for Protein: B2RUD9

Gm4787, MCG140564, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4787B2RUD9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm4787B2RUD9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms