Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zscan5bB2RTN3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zscan5bB2RTN3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms