Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Brpf3B2KF05 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms