Protein–RNA interactions for Protein: B1AZQ8

Cldn34b1, Claudin 34B1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b1B1AZQ8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34b1B1AZQ8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms