Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ssxb8B1AY40 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ssxb8B1AY40 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ssxb8B1AY40 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ssxb8B1AY40 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ssxb8B1AY40 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ssxb8B1AY40 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ssxb8B1AY40 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssxb8B1AY40 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ssxb8B1AY40 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ssxb8B1AY40 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ssxb8B1AY40 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ssxb8B1AY40 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ssxb8B1AY40 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ssxb8B1AY40 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ssxb8B1AY40 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb8B1AY40 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ssxb8B1AY40 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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