Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NhsB1AV60 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NhsB1AV60 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms